Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn9Q9Z0S7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn9Q9Z0S7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cldn9Q9Z0S7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cldn9Q9Z0S7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn9Q9Z0S7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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