Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clcn5Q9WVD4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms