Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec2Q9WV35 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec2Q9WV35 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms