Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabbr1Q9WV18 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms