Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT7

Ccr9, C-C chemokine receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr9Q9WUT7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccr9Q9WUT7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccr9Q9WUT7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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