Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms