Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn4Q9WU22 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms