Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms