Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp18Q9WTV6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms