Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Nfe2l3Q9WTM4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Nfe2l3Q9WTM4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Nfe2l3Q9WTM4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Nfe2l3Q9WTM4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Nfe2l3Q9WTM4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Nfe2l3Q9WTM4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Nfe2l3Q9WTM4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Nfe2l3Q9WTM4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nfe2l3Q9WTM4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms