Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc2Q9R244 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms