Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms