Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hic1Q9R1Y5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hic1Q9R1Y5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms