Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms