Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Plod1Q9R0E2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms