Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lamc3Q9R0B6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms