Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nubp2Q9R061 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nubp2Q9R061 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nubp2Q9R061 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nubp2Q9R061 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nubp2Q9R061 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nubp2Q9R061 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nubp2Q9R061 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nubp2Q9R061 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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