Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col4a3Q9QZS0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms