Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms