Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms