Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmeff2Q9QYM9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms