Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd4Q9QY39 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms