Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms