Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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