Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcea2Q9QVN7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms