Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mid2Q9QUS6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid2Q9QUS6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms