Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cln8Q9QUK3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms