Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdc42ep4Q9JM96 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdc42ep4Q9JM96 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms