Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabgef1Q9JM13 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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