Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col5a3Q9JLI2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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