Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod4Q9JLH8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Tmod4Q9JLH8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod4Q9JLH8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms