Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l2Q9JLG4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms