Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace2Q9JL18 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace2Q9JL18 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace2Q9JL18 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace2Q9JL18 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace2Q9JL18 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bace2Q9JL18 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bace2Q9JL18 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms