Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms