Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms