Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Irx5Q9JKQ4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx5Q9JKQ4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Irx5Q9JKQ4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Irx5Q9JKQ4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Irx5Q9JKQ4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Irx5Q9JKQ4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Irx5Q9JKQ4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms