Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms