Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx6Q9JKK1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms