Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms