Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms