Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddx20Q9JJY4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ddx20Q9JJY4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms