Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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