Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms