Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms