Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms