Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpf2Q9JJ80 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms