Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms