Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms