Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms