Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms